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R 常用操作汇总

显示某个包中包含的全部数据集

  • 怎样显示 R 软件中某个包中包含的全部数据集
> library(MASS)
> data()
> data(package="MASS")

查看包加载的路径

  • 查看包加载的路径
library(ggplot2)
system.file(package = 'ggplot2')
find.package("ggplot2")

加载指定路径的 R 包

  • 指定加载特定路径下的 R 包

通常我们都是直接使用 library(pkg_name)  的形式加载 R 包,在同一台机器上面,对于我们而言,这个包所在的路径一定是在 .libPaths()  里面的,但是对于其他用户而言,这个路径可能不存在 .libPaths()  里面,此时,就无法正确的加载该 R 包,为了解决这一问题,可以通过添加 lib.loc  参数,指定查找该包的路径。

library(gplots, lib.loc="/usr/lib64/R/library/gplots")

查看包安装目录

  • 查看包的安装目录: .libPaths()

查看包里的所有函数

  • 查看该包里面所有的函数: ls('package:ggplot2')

查看已经安装的包有哪些

  • 查看已经安装的包目录: library()

查看已安装的包的信息

> installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')]
> installed.packages()["ggplot2",c('Package','Version','LibPath')]

# 其中 c('Package','Version','LibPath') 表示显示包名、版本、库路径信息,若无[,c('Package','Version','LibPath')]参数,则显示所有信息。

载入 R 包

  • 载入 mypackage 包: library(mypackage)

查看启动 R 时自动载入的包

  • 查看启动 R 时自动载入的包: getOption("defaultPackages")

查看当前载入的包

  • 查看当前载入的包: search()

查看 R 中载入的包

  • 查看 R 中载入的包: sessionInfo()

查看包的帮助信息

  • 查看 ‘mypackage’ 的帮助信息: help(package = 'mypackage')

查看包的版本

  • 查看 ‘mypackage’ 的版本:packageVersion('mypackage')

查看函数的参数

  • 查看函数的参数: args(function)

自动运行该函数帮助文档中的例子

  • 自动运行该函数帮助文档中的例子: example(function)

展示一些包中 demostration

  • 展示一些包中 demostration: demo("package")

查看 vignette

  • 有的包,特别是 bioconductor 的包有 vignette,用函数查看: vignette('mypackage')
  • 查看 vignette: openVignette('mypackage')

搜索 R 网站上的 “helpinfor” 相关信

  • 搜索 R 网站上的 “helpinfor” 相关信息: RSiteSearch("helpinfor")

查看已经安装包的详细 HTML 文档

  • 查看已经安装包的详细 HTML 文档: help.start()

查看 S4 类的方法

  • 查看 S4 类的方法: showMethods(class = "myClass")

查看 method 的代码

  • 查看 method 的代码: findMethods("myMethods")

查看某个对象的类

  • 查看某个对象的类: class(myObject)

查看某个 class 或者包的具体内容

  • 查看某个 class 或者包的具体内容: getClass("class/package")

查看某个 class 的 slot

  • 查看某个 class 的 slot: getSlots("class")

查看某个对象的 slot

  • 查看某个对象的 slot: slotNames(MyObject)

卸除已加载的包

  • 卸除已加载的包
> detach("package:RMySQL")

# 注意是卸除,不是卸载,也就是说不是把包从 R 运行环境中彻底删除,只是不希望该包被加载使用。
# 该命令在包使用函数冲突,检验函数依赖时比较有用。